Analyses of Genetic Diversity by SSR Molecular Markers and Agronomic Traits Diversity in Squash and Pumpkin

doi:10.11869/j.issn.100-8551.2021.12.2746

Journal of Nuclear Agricultural Sciences ›› 2021, Vol. 35 ›› Issue (12): 2746-2755.DOI: 10.11869/j.issn.100-8551.2021.12.2746

• Induced Mutations for Plant Breeding·Agricultural Biotechnology • Previous Articles Next Articles

Analyses of Genetic Diversity by SSR Molecular Markers and Agronomic Traits Diversity in Squash and Pumpkin

HUANG Kaimei¹(), ZOU Yijing¹, SHI Yangqi², YING Yining³, YAN Shaobing¹, BAO Jinsong²^,³^,^*()

¹Hangzhou Center for Agricultural Technology Extension, Hangzhou, Zhejiang 310017
²Department of Applied Bioscience,College of Agriculture and Biotechnology, Zhejiang University, Hangzhou, Zhejiang 310058
³Institute of Nuclear Agricultural Sciences, Zhejiang University, Hangzhou, Zhejiang 310058

Received:2021-04-29 Revised:2021-07-08 Online:2021-12-10 Published:2021-10-25
Contact: BAO Jinsong

南瓜栽培品种的SSR分子标记分析及农艺性状多样性研究

黄凯美¹(), 邹宜静¹, 施杨琪², 应逸宁³, 颜韶兵¹, 包劲松²^,³^,^*()

¹杭州市农业技术推广中心, 浙江杭州 310017
²浙江大学农学院应用生物科学系, 浙江杭州 310058
³浙江大学原子核农业科学研究所, 浙江杭州 310058

通讯作者: 包劲松
作者简介:黄凯美,女,高级农艺师,从事蔬菜新品种选育及推广工作。E-mail: haungkm@163.com
基金资助:
杭州市农业和社会发展科研主动设计项目(20180416A04)

Abstract

Abstract:

In order to study the genetic diversity of squash and pumpkin (Cucurbita) cultivars and landrace, molecular marker analysis of 35 accessions were investigated with 43 simple sequence repetition (SSR) markers. The agronomic traits were also investigated. The results showed that all the SSR markers can produce polymorphic bands among 35 accessions. A total of 155 alleles were detected with an average of 4.1 alleles for individual marker. The polymorphism information content (PIC) was ranged from 0.130 8 to 0.775 4 with an average value of 0.487 2. The cluster analysis of 35 accessions by the unweighted pair group average method with arithmetic mean (UPGMA) indicated that all the accessions could be divided into three categories, corresponding to the American squash (C. pepo L.), Chinese pumpkin (C. moschato Duch) and Indian squash (C. maxima Duch), of which the Indian squash had a closer genetic relatedness to the American squash. Analysis of the agronomic characters of different accessions indicated that dramatic diversity in the agronomic traits was found not only among different species but also among different cultivars of the same species. This study provided a reference for further study on the genetic structure, fingerprinting construction, and molecular breeding of cucurbita cultivars.

Key words: squash, SSR, cluster analysis, genetic diversity, molecular breeding

摘要：

为了研究南瓜栽培品种的遗传多样性,本研究利用43个简单序列重复(SSR)分子标记,对35份南瓜育成品种及地方品种进行了分子标记分析,并调查了农艺性状。结果表明,43个SSR标记均能扩增出多态性条带,共检测到155个等位基因,平均每个标记能检测到3.6个等位基因,多态性信息含量(PIC)为0.130 8~0.775 4,平均值为0.487 2。利用非加权组平均法(UPGMA)进行聚类分析,结果表明35份材料可分为三大类,分别与中国南瓜、印度南瓜和美洲南瓜三个种吻合,且印度南瓜与美洲南瓜之间的亲缘关系较近。农艺性状调查结果表明,不同栽培种之间以及同一栽培种内的不同品种之间,都发现有农艺性状差别明显的情况。本研究为南瓜种质资源的保护、品种指纹图谱的建立及分子育种提供了理论依据。

关键词: 南瓜, SSR, 聚类分析, 遗传多样性, 分子育种

HUANG Kaimei, ZOU Yijing, SHI Yangqi, YING Yining, YAN Shaobing, BAO Jinsong. Analyses of Genetic Diversity by SSR Molecular Markers and Agronomic Traits Diversity in Squash and Pumpkin[J]. Journal of Nuclear Agricultural Sciences, 2021, 35(12): 2746-2755.

黄凯美, 邹宜静, 施杨琪, 应逸宁, 颜韶兵, 包劲松. 南瓜栽培品种的SSR分子标记分析及农艺性状多样性研究[J]. 核农学报, 2021, 35(12): 2746-2755.

Figures/Tables 5

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创刊：1987年
主管部门：农业农村部
主办单位：中国原子能农学会与中国农业科学院农产品加工研究所（前中国农业科学院原子能利用研究所）
ISSN：1000-8551

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序号 Code	品种 Cultivar	来源地 Origin		栽培类型 Species		生长习性 Growth habit		始花节位 First flower node		结瓜习性 Fruiting habit		叶形 Leaf shape		茎形状 Stem shape		雌花萼片 Female flower sepal shape		单瓜重 Single fruit weight /g		瓜形 Fruit shape		皮色 Skin color		瓜面斑纹 Surface stripe		瓜面特征 Surface		瓜肉色 Flesh color		瓜肉厚 Flesh thickness /cm		品质 Quality
PM01	世龙碧玉	湖南		中国南瓜		蔓生		26		主蔓		掌状		五棱形		叶状		686.0		圆球形		深绿色		无		平滑		淡黄		1.4		致密, 脆
PM02	一串铃 2号	湖南		中国南瓜		蔓生		14		主蔓		掌状		五棱形		叶状		751.5		圆球形		深绿色		无		平滑		淡黄		1.3		松软, 脆, 略甜
PM03	一串铃 4号	湖南		中国南瓜		蔓生		12		主蔓		掌状		五棱形		叶状		593.5		圆球形		淡绿色		白色点状花纹		平滑		淡黄		1.2		松软, 脆, 清甜
PM04	通宝	北京		中国南瓜		蔓生		14		主蔓		掌状		五棱形		叶状		736.0		倒卵形		深绿色		无		平滑		淡黄		1.3		致密, 脆
PM05	麻皮	浙江		中国南瓜		蔓生		23		主蔓		掌状五角		五棱形		叶状		687.5		扁圆形		墨绿色		无		平滑		淡黄		1.8		致密, 脆
PM06	威狼	浙江		中国南瓜		蔓生		28		主蔓		心脏五角		五棱形		叶状		738.0		长把梨形		深绿色		无		平滑		淡黄		0.9		松软, 脆, 不甜
PM07	狼崽	浙江		中国南瓜		蔓生		8		主蔓		掌状		五棱形		叶状		393.5		短把梨形		墨绿色		无		平滑		淡黄		0.7		松软, 面, 甜
PM08	十姐妹	浙江		中国南瓜		蔓生		27		主蔓		掌状		五棱形		叶状		673.0		长把梨形		深绿色		无		平滑		淡黄		0.7		松软, 面, 甜
PM09	蜜本南瓜	广东		中国南瓜		蔓生		29		侧蔓		心脏五角		五棱形		叶状		723.0		短把梨形		绿色		不规则		平滑		淡黄		1.0		松软, 脆
PM10	袖珍蜜本3号	湖南		中国南瓜		蔓生		10		主蔓		掌状		五棱形		叶状		783.0		短把梨形		深绿色		无		平滑		淡黄		0.9		致密, 脆
PM11	火腿蜜本1号	湖南		中国南瓜		蔓生		16		主蔓		心脏五角		五棱形		叶状		774.5		长把梨形		墨绿色		无		平滑		淡黄		1.1		致密, 脆
PM12	黄狼南瓜	上海		中国南瓜		蔓生		21		侧蔓		掌状		五棱形		叶状		653.3		长把梨形		墨绿色		无		平滑		淡黄		1.1		致密, 脆
PM14	香芋南瓜	广东		中国南瓜		蔓生		34		侧蔓		近圆形		五棱形		叶状		488.0		橄榄形		绿色		白绿色		平滑		淡黄		1.5		致密, 脆
PM15	劳斯	广东		印度南瓜		蔓生		27		侧蔓		掌状		近圆形		狭长		930.0		纺锤形		灰绿色		深绿色		平滑		黄		1.2		松软, 脆
PM16	橄榄翡翠	山东		印度南瓜		蔓生		27		侧蔓		掌状		近圆形		狭长		968.0		橄榄形		绿色		灰绿色		平滑		黄		1.5		致密, 脆, 略甜
序号 Code	品种 Cultivar		来源地 Origin		栽培类型 Species		生长习性 Growth habit		始花节位 First flower node		结瓜习性 Fruiting habit		叶形 Leaf shape		茎形状 Stem shape		雌花萼片 Female flower sepal shape		单瓜重 Single fruit weight /g		瓜形 Fruit shape		皮色 Skin color		瓜面斑纹 Surface stripe		瓜面特征 Surface		瓜肉色 Flesh color		瓜肉厚 Flesh thickness /cm		品质 Quality
PM17	HN20_16		浙江		印度南瓜		蔓生		28		侧蔓		掌状		近圆形		狭长		621.0		橄榄形		深绿色		灰绿色		平滑		黄		1.1		致密, 脆, 甜
PM19	李白		上海		印度南瓜		蔓生		25		主蔓		掌状		近圆形		狭长		759.0		近似桃形		白色		隐约有浅绿条纹		平滑		淡黄		1.5		松软, 脆, 甜
PM20	灰姑娘		浙江		印度南瓜		蔓生		13		主蔓		近圆形		近圆形		狭长		664.0		扁圆形		灰绿色		无		平滑		淡黄		1.5		致密, 粉
PM21	荃银黑晶		安徽		印度南瓜		蔓生		17		主蔓		掌状		近圆形		狭长		525.5		扁圆形		墨绿色		无		平滑		黄		1.6		松软, 粉
PM22	翠栗 6号		浙江		印度南瓜		蔓生		23		主蔓		掌状		近圆形		狭长		545.5		扁圆形		绿色		浅绿色		平滑		黄		1.7		松软, 面, 甜
PM23	大贝贝 2号		北京		印度南瓜		蔓生		16		主蔓		掌状		近圆形		狭长		466.0		扁圆形		墨绿色		浅绿细条纹		平滑		黄		1.6		松软, 粉
PM24	贝贝		上海		印度南瓜		蔓生		23		主蔓		掌状		近圆形		狭长		402.0		扁圆形		墨绿色		浅绿细条纹		平滑		黄		1.5		致密, 粉
PM25	禄福 305		广东		印度南瓜		蔓生		25		主蔓		心脏形		近圆形		狭长		635.3		扁圆形		墨绿色		浅绿色斑条		平滑		黄		2.0		甜,致密,粉
PM26	红香 1号		湖南		印度南瓜		蔓生		17		主蔓		近圆形		近圆形		狭长		1 306.0		扁圆形		橙黄色		无		平滑		黄		2.3		致密, 脆
PM27	贵红 2号		浙江		印度南瓜		蔓生		22		主蔓		近圆形		近圆形		狭长		1 030.0		近圆形		黄色		无		平滑		黄		1.9		致密, 脆
PM28	小泉一郎		上海		印度南瓜		蔓生		15		主蔓		掌状		近圆形		狭长		1 031.0		近圆形		黄色		无		平滑		黄		1.8		致密, 面
PM29	皇贝贝		北京		美洲南瓜		蔓生		13		主蔓		近三角形		有棱或沟		狭长		353.0		扁圆形		浅黄色		黄色纵条纹		多棱		淡黄		1.7		致密, 面
PM30	桔瓜		上海		美洲南瓜		蔓生		13		主蔓		近三角形		有棱或沟		狭长		270.0		扁圆形		黄橙色		橙色纵条纹		多棱		淡黄		1.5		松软, 粉
PM31	迷你白		上海		美洲南瓜		蔓生		12		主蔓		近三角形		有棱或沟		狭长		270.6		扁圆形		白色		无		多棱		白		1.8		致密, 面略粉
PM32	金丝绞瓜		河北		美洲南瓜		矮生		12		主蔓		近三角形		有棱或沟		狭长		791.0		椭圆形		浅黄白色		无		平滑		白		1.5		致密, 脆, 甜
PM33	冬秀西葫芦		辽宁		美洲南瓜		矮生		19		主蔓		近三角形		有棱或沟		狭长		505.5		圆筒形		浅绿		无		平滑		白		1.2		松软, 脆, 不甜,
PM34	红南瓜		浙江		印度南瓜		蔓生		13		主蔓		掌状		近圆形		狭长		350.0		扁圆形		橙红色		无		平滑		黄		1.3		致密, 面
PM35	墨童		浙江		印度南瓜		蔓生		13		主蔓		掌状		近圆形		狭长		207.0		扁圆形		深绿		浅绿细条纹		平滑		黄		1.3		松软, 面
PM36	灰精灵		浙江		印度南瓜		蔓生		16		主蔓		心脏五角		近圆形		狭长		288.5		扁圆形		深灰绿色		无		平滑		黄		1.7		致密, 细腻, 面,
PM37	红玲珑		浙江		印度南瓜		蔓生		17		主蔓		掌状		近圆形		狭长		203.5		近圆形		橘红色		浅橙红条纹		平滑		黄		0.9		致密, 硬, 粉

序号 Code	品种 Cultivar	来源地 Origin		栽培类型 Species		生长习性 Growth habit		始花节位 First flower node		结瓜习性 Fruiting habit		叶形 Leaf shape		茎形状 Stem shape		雌花萼片 Female flower sepal shape		单瓜重 Single fruit weight /g		瓜形 Fruit shape		皮色 Skin color		瓜面斑纹 Surface stripe		瓜面特征 Surface		瓜肉色 Flesh color		瓜肉厚 Flesh thickness /cm		品质 Quality
PM01	世龙碧玉	湖南		中国南瓜		蔓生		26		主蔓		掌状		五棱形		叶状		686.0		圆球形		深绿色		无		平滑		淡黄		1.4		致密, 脆
PM02	一串铃 2号	湖南		中国南瓜		蔓生		14		主蔓		掌状		五棱形		叶状		751.5		圆球形		深绿色		无		平滑		淡黄		1.3		松软, 脆, 略甜
PM03	一串铃 4号	湖南		中国南瓜		蔓生		12		主蔓		掌状		五棱形		叶状		593.5		圆球形		淡绿色		白色点状花纹		平滑		淡黄		1.2		松软, 脆, 清甜
PM04	通宝	北京		中国南瓜		蔓生		14		主蔓		掌状		五棱形		叶状		736.0		倒卵形		深绿色		无		平滑		淡黄		1.3		致密, 脆
PM05	麻皮	浙江		中国南瓜		蔓生		23		主蔓		掌状五角		五棱形		叶状		687.5		扁圆形		墨绿色		无		平滑		淡黄		1.8		致密, 脆
PM06	威狼	浙江		中国南瓜		蔓生		28		主蔓		心脏五角		五棱形		叶状		738.0		长把梨形		深绿色		无		平滑		淡黄		0.9		松软, 脆, 不甜
PM07	狼崽	浙江		中国南瓜		蔓生		8		主蔓		掌状		五棱形		叶状		393.5		短把梨形		墨绿色		无		平滑		淡黄		0.7		松软, 面, 甜
PM08	十姐妹	浙江		中国南瓜		蔓生		27		主蔓		掌状		五棱形		叶状		673.0		长把梨形		深绿色		无		平滑		淡黄		0.7		松软, 面, 甜
PM09	蜜本南瓜	广东		中国南瓜		蔓生		29		侧蔓		心脏五角		五棱形		叶状		723.0		短把梨形		绿色		不规则		平滑		淡黄		1.0		松软, 脆
PM10	袖珍蜜本3号	湖南		中国南瓜		蔓生		10		主蔓		掌状		五棱形		叶状		783.0		短把梨形		深绿色		无		平滑		淡黄		0.9		致密, 脆
PM11	火腿蜜本1号	湖南		中国南瓜		蔓生		16		主蔓		心脏五角		五棱形		叶状		774.5		长把梨形		墨绿色		无		平滑		淡黄		1.1		致密, 脆
PM12	黄狼南瓜	上海		中国南瓜		蔓生		21		侧蔓		掌状		五棱形		叶状		653.3		长把梨形		墨绿色		无		平滑		淡黄		1.1		致密, 脆
PM14	香芋南瓜	广东		中国南瓜		蔓生		34		侧蔓		近圆形		五棱形		叶状		488.0		橄榄形		绿色		白绿色		平滑		淡黄		1.5		致密, 脆
PM15	劳斯	广东		印度南瓜		蔓生		27		侧蔓		掌状		近圆形		狭长		930.0		纺锤形		灰绿色		深绿色		平滑		黄		1.2		松软, 脆
PM16	橄榄翡翠	山东		印度南瓜		蔓生		27		侧蔓		掌状		近圆形		狭长		968.0		橄榄形		绿色		灰绿色		平滑		黄		1.5		致密, 脆, 略甜
序号 Code	品种 Cultivar		来源地 Origin		栽培类型 Species		生长习性 Growth habit		始花节位 First flower node		结瓜习性 Fruiting habit		叶形 Leaf shape		茎形状 Stem shape		雌花萼片 Female flower sepal shape		单瓜重 Single fruit weight /g		瓜形 Fruit shape		皮色 Skin color		瓜面斑纹 Surface stripe		瓜面特征 Surface		瓜肉色 Flesh color		瓜肉厚 Flesh thickness /cm		品质 Quality
PM17	HN20_16		浙江		印度南瓜		蔓生		28		侧蔓		掌状		近圆形		狭长		621.0		橄榄形		深绿色		灰绿色		平滑		黄		1.1		致密, 脆, 甜
PM19	李白		上海		印度南瓜		蔓生		25		主蔓		掌状		近圆形		狭长		759.0		近似桃形		白色		隐约有浅绿条纹		平滑		淡黄		1.5		松软, 脆, 甜
PM20	灰姑娘		浙江		印度南瓜		蔓生		13		主蔓		近圆形		近圆形		狭长		664.0		扁圆形		灰绿色		无		平滑		淡黄		1.5		致密, 粉
PM21	荃银黑晶		安徽		印度南瓜		蔓生		17		主蔓		掌状		近圆形		狭长		525.5		扁圆形		墨绿色		无		平滑		黄		1.6		松软, 粉
PM22	翠栗 6号		浙江		印度南瓜		蔓生		23		主蔓		掌状		近圆形		狭长		545.5		扁圆形		绿色		浅绿色		平滑		黄		1.7		松软, 面, 甜
PM23	大贝贝 2号		北京		印度南瓜		蔓生		16		主蔓		掌状		近圆形		狭长		466.0		扁圆形		墨绿色		浅绿细条纹		平滑		黄		1.6		松软, 粉
PM24	贝贝		上海		印度南瓜		蔓生		23		主蔓		掌状		近圆形		狭长		402.0		扁圆形		墨绿色		浅绿细条纹		平滑		黄		1.5		致密, 粉
PM25	禄福 305		广东		印度南瓜		蔓生		25		主蔓		心脏形		近圆形		狭长		635.3		扁圆形		墨绿色		浅绿色斑条		平滑		黄		2.0		甜,致密,粉
PM26	红香 1号		湖南		印度南瓜		蔓生		17		主蔓		近圆形		近圆形		狭长		1 306.0		扁圆形		橙黄色		无		平滑		黄		2.3		致密, 脆
PM27	贵红 2号		浙江		印度南瓜		蔓生		22		主蔓		近圆形		近圆形		狭长		1 030.0		近圆形		黄色		无		平滑		黄		1.9		致密, 脆
PM28	小泉一郎		上海		印度南瓜		蔓生		15		主蔓		掌状		近圆形		狭长		1 031.0		近圆形		黄色		无		平滑		黄		1.8		致密, 面
PM29	皇贝贝		北京		美洲南瓜		蔓生		13		主蔓		近三角形		有棱或沟		狭长		353.0		扁圆形		浅黄色		黄色纵条纹		多棱		淡黄		1.7		致密, 面
PM30	桔瓜		上海		美洲南瓜		蔓生		13		主蔓		近三角形		有棱或沟		狭长		270.0		扁圆形		黄橙色		橙色纵条纹		多棱		淡黄		1.5		松软, 粉
PM31	迷你白		上海		美洲南瓜		蔓生		12		主蔓		近三角形		有棱或沟		狭长		270.6		扁圆形		白色		无		多棱		白		1.8		致密, 面略粉
PM32	金丝绞瓜		河北		美洲南瓜		矮生		12		主蔓		近三角形		有棱或沟		狭长		791.0		椭圆形		浅黄白色		无		平滑		白		1.5		致密, 脆, 甜
PM33	冬秀西葫芦		辽宁		美洲南瓜		矮生		19		主蔓		近三角形		有棱或沟		狭长		505.5		圆筒形		浅绿		无		平滑		白		1.2		松软, 脆, 不甜,
PM34	红南瓜		浙江		印度南瓜		蔓生		13		主蔓		掌状		近圆形		狭长		350.0		扁圆形		橙红色		无		平滑		黄		1.3		致密, 面
PM35	墨童		浙江		印度南瓜		蔓生		13		主蔓		掌状		近圆形		狭长		207.0		扁圆形		深绿		浅绿细条纹		平滑		黄		1.3		松软, 面
PM36	灰精灵		浙江		印度南瓜		蔓生		16		主蔓		心脏五角		近圆形		狭长		288.5		扁圆形		深灰绿色		无		平滑		黄		1.7		致密, 细腻, 面,
PM37	红玲珑		浙江		印度南瓜		蔓生		17		主蔓		掌状		近圆形		狭长		203.5		近圆形		橘红色		浅橙红条纹		平滑		黄		0.9		致密, 硬, 粉

SSR标记 SSR marker	上游引物(5'-3') Forward primer(5'-3')	下游引物(5'-3') Reverse primer(5'-3')	参考文献 Reference
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CMTp187	AACAATCCTCGCCTCAAATC	ATGAAAATGGGAAGCCAGAG	[18]
CMTp193	GGTGACGGCAAGAAAAGCTA	GCTGACCCTCTCTCCCTCTC	[18]
CMTp209	TCACTTTACAACCAGAAGCTGA	CACTTTGCTGCTCATCCAC	[18]
CMTp224	CACCGACGACTCCATCATC	CTTCTTGTCCCCAAAATCACA	[18]
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CMTp187	AACAATCCTCGCCTCAAATC	ATGAAAATGGGAAGCCAGAG	[18]
CMTp193	GGTGACGGCAAGAAAAGCTA	GCTGACCCTCTCTCCCTCTC	[18]
CMTp209	TCACTTTACAACCAGAAGCTGA	CACTTTGCTGCTCATCCAC	[18]
CMTp224	CACCGACGACTCCATCATC	CTTCTTGTCCCCAAAATCACA	[18]
CMTp256	CTGTTCGTAGCCGATGTCTG	TGGACTTCATGCATATTGTGTG	[18]
SSR标记 SSR marker	上游引物(5'-3') Forward primer(5'-3')	下游引物(5'-3') Reverse primer(5'-3')	参考文献 Reference
CMTp257	CACGAAGATTTGATGGCCTTA	GGATTGGGATGGTGAAGATG	[18]
CMTp260	CCCTAGACCCATCATAGTCG	ACATTTGGTTACTTCCCCATT	[18]
CMTp69	ATACTTGCTCCCCAAGTTTA	AAATAAAAAGACAACGTAATGGT	[18]
CMTp88	ACCTACCGTCACACCCACAT	CCACCTGAAAACAGGGCTAA	[18]
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n12	AGCCTTTCAGAAGAACCAAG	GGCTTCAAACAAATACTAACCA	[19]
n15	ACGTTCTTTCTGCCTCCAT	ATGCCCATTATGCAATTCTC	[19]
n9	CCCAAATTCAAAAGAAAATC	CCAGTTAAATCAGACCGAAT	[19]
S105	TTCAAAGCTTCTCTGGTAAGGC	ACATCGCCCAAGAGAAGTTG	[19]
S112	TTTGATGGTTTGCGACGTTA	TGGTGCTGTTGCTGAAAATC	[19]
S1497	ATGGCATAATCAGCCCTCAC	TTTGAAGAAGGGAAGAGGGG	[19]
S1498	TCAAACTCTCAACTGGGTCG	TCCGATTGAGAGCTGGAGTT	[19]
S1535	GGTGTGTACAAAGGGCAGGT	TCACTGCAATTTCACGTTCG	[19]
S1702	CGAGGTGAAGGTTAAACGGA	AGAACGCGCATGCTAAGAGT	[19]
S1779	GGGTGAAGCTGTGGATTCAT	TCTCTAGTGCCACACTCAAGTACA	[19]
S190	TGTGGGGTTTTGCTTTTAGG	ATCCAAAATGGTGGTGCATT	[19]
S28	TTCTCAGGTGCTGTTGATGC	TCCTTTCCTTCGCTTCCTCT	[20]
S31	GCTTTTGAAGATGAGGCGAG	CACTCAAGCAGATTGCCAAA	[20]
S39	CGTTTTCACAAAACCCTCGT	GAGAAGAGCAACGCTTTCGT	[20]
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S48	TCGAAATTCGCCATTCTTTC	TGCAGATTTTGCTCACTTGG	[20]
S5	GAGATACCTTAATCCTCTGTTTGG	TCAGTTCAGAGCTTCGCAGA	[20]
S65	ATCATAGTCGTCGTCGGGTC	GCCGATTCTTGAGGAACAGA	[20]
S78	ACCAAAATGTCCCGAAAACA	AAATCTCACGTTCAGGTCCG	[20]
S88	GCTTGTGGGCAAAGTAAAGC	GGGAAGGGGAGGAGAAGATA	[20]
S9	GTGAGCTTCTGGACGAGGTC	CTCAAAAGCACTCCACTCCC	[20]
sp11	CAAGCCAACCACGACAT	AAGAGTTATCAAGACCAGCAT	[21]
sp2	TCGCAAGCCAACCAC	TATCAAGACCAGCATTCGT	[21]
sp39	TAGTAAATAGTCAGATGGGGAG	GTTCATAATTGAAGGGGTTC	[21]
sp40	AAGCCAACCACGACATTT	GACGACCTTGCTGCAAAG	[21]
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sp44	AGATTACCTACCAGCGTTTT	TTTGTCCCTTTTCTTCCC	[21]
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sp51	TTACACCTCTTCGACCTTCT	GCTTGTCACTTCCACTTTTT	[21]
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标记 Marker	主要等位基因频率MAF	基因型数 Genotype number	等位基因数 Allele number	基因多样性 Gene diversity	杂合度 Heterozygosity	多态信息含量PIC
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平均值Mean	0.550 1	4.1	3.6	0.551 7	0.199 2	0.487 2

Analyses of Genetic Diversity by SSR Molecular Markers and Agronomic Traits Diversity in Squash and Pumpkin

南瓜栽培品种的SSR分子标记分析及农艺性状多样性研究

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